Загрязнение воды и донных отложений практически во всех реках и водоемах не представляет опасности для водопользования. Исключение составляют несколько озер, в том числе озеро Кожановское (запасы цезия около 100 Ки при площади зеркала 6.5 кв.км.). Содержание цезия-137 в образцах рыбы из данного водоема многократно превосходит допустимые уровни.

За пределами бывшего Советского Союза прямое и косвенное загрязнение озер вызывало и продолжает вызывать много проблем, поскольку рыба в этих озерах загрязнена на уровне, делающем ее неприемлемой для продажи на рынке. Так, например, в Швеции в 1987 году примерно в 14000 озер (т.е. 15% от их общего числа в Швеции) рыба имела концентрацию радиоцезия, превышающую 1500 Бк/кг (установленный в Швеции предел для продажи озерной рыбы). Период экологического полураспада, который зависит от вида рыбы и типа озера, варьируется от нескольких лет до нескольких десятков лет.